Музей располагается в небольшом деревянном доме, построенном в 1896–1898 годах в качестве городской усадьбы Дмитровского уездного предводителя дворянства графа М. Олсуфьева. Среди обстановки дома особый интерес представляют подлинные печи и камин конца XIX века. Уникальными экспонатами являются бюст П. Кропоткина работы скульптора И. Гинзбурга и подлинная посмертная маска Кропоткина.
Фотографии и рисунки рассказывают о семье, княжеском происхождении Петра Алексеевича, учебе в Петербургском Пажеском корпусе, службе в Амурском казачьем полку в Сибири. Размещены карты экспедиций, рисунки, фотографии мест, открытых благодаря Кропоткину.
В гостиной представлены предметы быта, воссоздающие атмосферу дворянского уездного дома конца XIX века. Печи и камины дома — особая гордость, артефакты той эпохи. Документы отражают дмитровский период жизни Кропоткина: научно-исследовательскую работу, помощь в создании первой музейной экспозиции.
В лекционном зале — плакаты, стенды, витрины, которые рассказывают о зарождении и развитии анархизма, роли Кропоткина в нем, современном состоянии этого политического движения. Демонстрация фильмов на эту тему дополняет информационное пространство.
В кабинете-спальне Кропоткина воссоздана атмосфера комнаты, в которой завершился его земной путь. На втором этаже представлены камни, кости, таксидермические экспонаты, гербарии, карты и т. д. Имеется тематическая зона для проведения интерактивных программ.