Музей фресок Дионисия размещен в Ферапонтовом монастыре, основанном в 1398 году. Монастырь стоит на высоком холме между двух озер и являет собой редкий пример сохранности и стилевого единства северного монастырского ансамбля XV–XVII вв.
Собор Рождества Богородицы 1490 года — самый ранний каменный храм на Русском Севере. В соборе в полном композиционном составе сохранились фрески 1502 года, исполненные артелью древнерусского художника Дионисия. Это единственный дошедший до нашего времени монументальный проект великого мастера.
Здесь экспонируются древнейшие иконы, в том числе Дионисия и его мастерской, предметы, связанные с историей монастыря и окружающих его земель. Музейные фонды включают в себя коллекции живописи, графики, книг, металла, керамики, ткани и дерева.
Современный Музей фресок Дионисия, объект ЮНЕСКО — это туристический, научно-просветительский центр, распространяющий знания об уникальных памятниках ансамбля Ферапонтова монастыря через разнообразные формы музейной работы.