Идея создания музея в Саранпауле появилась в 1990 году и принадлежит совету ветеранов поселка. Собрав документы, фото, предметы быта, энтузиасты передали экспонаты в Этнографический центр, созданный в 1993 году. В 1999 году на базе Этнографического центра был создан музей.
С марта 2012 года при музее работает детское объединение «Исторический клуб». Чтобы музей стал интересен людям, коллектив вкладывает много усилий и применяет новые технологии.
В 2012 году Саранпаульский краеведческий музей признан лучшим предприятием Березовского района, и эта награда говорит о том, что маленький деревенский музей оказался актуальным и современным.
С 20 января 2014 года музей располагается на 2-м этаже здания Саранпаульского дома культуры. На сегодняшний день для посетителей доступны экспозиции «Люди хрустальных рек», «Ляпинский хлеб», «Геологическая эра Саранпауля». На 1 января 2021 года в музее 4 107 единиц хранения, из них 3 618 единиц основного фонда.