В селе Кваркено историко-краеведческий музей был открыт в марте 2000 года на основе собранных историко-краеведческих материалов о Кваркенском районе супругами Иваном Кузьмичем и Александрой Ивановной Коцаревыми. Первым директором музея была Александра Ивановна.
В 2008 году музей был награжден почетной грамотой за активную работу по патриотическому воспитанию молодежи. Продолжено развитие экскурсионной работы как одного из основных направлений деятельности, позволяющего публично представить населению музейные предметы.
Сегодня музей насчитывает более 2 100 экспонатов, 16 экспозиций, которые каждый год пополняются. Ведутся исследования на местах бывших поселений: в селе Алтуй у истока реки Урус-Кискен; на правому берегу реки Каинда; в месте «Цыганский табор» севернее поселка Красноярского; на Белом холме; на правом берегу реки Айдырля на месте бывших поселков Восточного и Прииска Айдырля.