Школа как самостоятельное образовательное учреждение открыта 1 сентября 1966 года, контингент учащихся определялся заселением прилежащего микрорайона.
В настоящее время образовано 21 класс — комплект, в которых обучается 610 человек.
Прилегающий к школе микрорайон разнороден. Основная масса детей — жители микрорайона. Характерной чертой жизни и работы школы вот уже в течение ряда последних лет является стабильность. В школе работает стабильный коллектив педагогов, состоящий в основном из добросовестных, работоспособных, творческих учителей.
Показателями успешности работы школы являются:
Выполнение закона «Об образовании в РФ». Стабильность роста качества знаний учащихся. Увеличение числа учащихся — победителей городских олимпиад. Достаточно высокие результаты по результатам ЕГЭ по русскому языку и математике.
В МОУ СОШ № 16 сложились определенные традиции: проведение дней здоровья, научно-практических конференций, экскурсий по краеведению.