Музей охраны природы был создан 1 марта 1988 года. Инициатором создания музея природы в селе Верхний Перевал выступил Борис Константинович Шибнев — ученый-орнитолог, этнограф, почетный житель Пожарского района, почетный доктор биологии, действительный член географического общества СССР, который считал делом своей жизни сохранение уникальной природы бассейна реки Бикин и экологическое просвещение жителей своей малой родины. 1 января 2006 года музей стал филиалом районного краеведческого музея и получил имя своего создателя.
Основные экспозиции музея составляют зоологическая коллекция и коллекция растительного мира уссурийской тайги. Музей является одной из немногих площадок в Приморском крае, которая представляет его уникальную флору и фауну. Он находится на пути туристических маршрутов в национальное село Красный Яр (место проживания коренных малочисленных народов севера Сибири и Дальнего Востока) и Национальный парк «Бикин».
Особой популярностью пользуются экологические уроки для средних и старших классов на экологическую тематику. Музей посещают не только школьники, жители села и прилегающих территорий, но и туристы из России и других стран. Приоритет отдается просветительской деятельности. Все занятия сегодня проводит внучка создателя музея Бориса Константиновича Шибнева — Ольга Михайловна Загустина.