Музей природы расположен во флигеле бывшего дома купца Г.В. Усова.
Светозвуковая экспозиция «Русский Север. Времена года» знакомит с животным и растительным миром края. В панорамной витрине можно увидеть кошку рысь и енотовидную собаку, лесных куликов вальдшнепов и семью медведей, выполненных корифеем отечественной таксидермии Н.К. Назьмовым.
Экспозиция «Живое прошлое Земли» посвящена палеонтологическим находкам и открытиям, сделанным в окрестностях Великого Устюга. Здесь представлены зубы, костные щитки, ребра парейазавров, слепки черепов пермских ящеров, впервые найденных на Устюжской земле, а также кости животных ледникового периода. Посетители смогут собрать макет скелета парейазавра.
В зале «Хозяин тайги» можно познакомиться с бурым медведем, его внешним видом, отпечатками лап, повадками, побывать в берлоге, «зайти в гости» к трем медведям.
О березе и ее значении в жизни природы и человека рассказывает экспозиция «Русская береза».
