Музей открыт для посетителей с 1996 года. Создала музей жительница села Ембаево В.А. Биктимирова — ветеран педагогического труда, отличник просвещения РСФСР. Это единственный музей в Тюменской области, раскрывающий историю и культуру сибирских татар. Он расположен в здании бывшего Магометанского духовного училища конца XIX века.
Сегодня в музее насчитывается более 3 000 экспонатов. Они раскрывают историю села, помогают заглянуть в прошлое и рассказывают о сегодняшнем дне. В фондах хранятся коллекции прикладного искусства, этнографии, культовых предметов, живописи и скульптуры, нумизматики, а также редкие и уникальные предметы, отражающие историю и культуру татарского народа и имеющие историческую и духовную ценность: учебники на арабском языке, метрические книги села Ембаево начала XX века, национальная одежда (головные уборы, обувь).
Учреждение занимается сбором, сохранением, исследованием музейных предметов, экспозиционно-выставочной деятельностью. Проводит экскурсии, лекции, консультации, семинары, конференции, круглые столы, встречи с интересными людьми. Также большое внимание уделяется поисково-исследовательской деятельности (пополнению исторических знаний по истории родного края).