Одним из объектов показа Тобольского историко-архитектурного музея-заповедника является Архиерейский дом, где в 2014 году совместно с Тобольско-Тюменской Митрополией осуществлен уникальный музейный проект «История православия в Сибири».
Тобольская епархия — старейшая в Сибири, была основана в 1620 г. На протяжении столетий сибирские епископы, митрополиты осуществляли миссионерскую, просветительскую, образовательную деятельность среди местного населения. Резиденция высшего духовенства Сибири — Архиерейский дом, была построена в 1775 году. Располагаясь на Софийской стороне Тобольского кремля, на протяжении более двух столетий здание являлось духовным центром. В XX веке дом использовался не по назначению, размещая в себе различные государственные службы. Сегодня мемориальному памятнику, с которым связаны многочисленные имена сибирских праведников, возвращено его историческое предназначение.
На сегодняшний день в Архиерейском доме располагается рабочий кабинет действующего митрополита Тобольского и Тюменского Димитрия, епархиальная канцелярия. В тронном зале проводятся встречи с духовенством, мирянами, воспитанниками православных гимназий, в архондарике — с представителями власти, гостями. В здании проводятся концерты духовной музыки. В июле 2014 г. в рамках фестиваля «Лето в Тобольском кремле» в тронном зале был дан концерт оркестра «Камерата Сибири» и хоровой капеллы Тюменской филармонии под управлением Антона Шароева.
Открытие в историческом здании Архиерейского дома экспозиции «История православия Сибири» послужило более широкому развитию туризма в Тюменской области. Данный проект органично лег на паломнический маршрут, являясь отправной точкой в повествовании о святых местах Зауралья.
Выставочный комплекс представляет собой иллюстрированную летопись рождения, становления и распространения православия с момента прихода отряда Ермака в Сибирь и до наших дней. Особое внимание уделено теме миссионерства — деятельности великих сибирских подвижников митрополитов Филофея Лещинского, Иоанна Тобольского, Павла Конюшкевича. Реализация проекта позволила полномасштабно представить богатейшую коллекцию православных раритетов Тобольского историко-архитектурного музея-заповедника. Специально для Архиерейского дома в ведущих реставрационных центрах России были отреставрировано более 200 предметов церковного искусства XVII–XVIII вв. По индивидуальному заказу разработано и изготовлено витринное оборудование. В постоянной экспозиции на малых площадях и в залах со сводами мультимедийные технологии органично дополняют заданную тему напольными и потолочными проекциями. У посетителя есть возможность увидеть карту православного освоения Российского Зауралья с динамикой продвижения и ощутить световой, звуковой и киноэффекты погружения. Исследовательские материалы, систематизированные, иллюстрированные и сопровождаемые выверенными комментариями и пояснениями, передают паломнику и туристу миссионерскую значимость духовного центра и ощущение подлинной атмосферы мемориального объекта, из которого продвигалось православное просветительство на восток России.