Музей располагается в здании лютеранской церкви, построенной в середине 1930-х годов, сейчас– это памятник регионального значения.
Музей работает с 1986 года. Из предметов второй половины XIX — начала ХХ в. наибольший интерес представляют экспонаты, помещенные в интерьерах «латгальской» и «русской» изб в экспозиционном зале: плетеная обувь, тканые предметы, а также подлинный герб с пограничного столба русско-латвийской границы 1930-х гг.
Интересны также комплексы фотографических материалов, связанные с историей города и городской государственной гимназии 1930-х г. г., когда Пыталовский район входил в состав Латвийской республики. Период 1941–1945 гг. наиболее интересно представлен фронтовыми письмами земляков и участников освобождения района и города от немецко-фашистских войск. Собственные фонды музея составляют 2 340 экспонатов, безвозмездно предоставленных музейных предметов из коллекции Псковского музея-заповедника для их экспонирования и хранения — 8 755 экспонатов.