Музей Мологского края имени Н.М. Алексеева был открыт в 1995 году как отдел Рыбинского музея-заповедника. Он посвящен истории и культуре Мологи и Мологского района, затопленных в начале 1940-х годов в результате строительства Рыбинской ГЭС. С тех пор на дне рукотворного Рыбинского моря покоятся фундаменты старинного города Мологи, около 30 сельских церквей, 3 монастырей и другие архитектурные памятники. Более 130 000 жителей этих земель стали вынужденными переселенцами.
Музей располагается в здании часовни бывшего рыбинского подворья Мологского Афанасьевского женского монастыря и является одним из редких островков уцелевшей мологской старины. В небольших уютных залах можно не только познакомиться с историей Мологи, но и почувствовать особое очарование этого самобытного уголка русской глубинки. Здесь организуются как обзорные экскурсии по залам музея, так и интерактивные занятия с конкурсами, призами и угощениями: «Базарный день» и «Ремеслу везде почет». В музее демонстрируются кадры кинохроник 1930-х годов о строительстве Рыбинской ГЭС, а также видеозаписи рассказов старых мологжан-переселенцев.