История Северского музыкального театра началась в мае 1957 года. Именно тогда в закрытом городе Северске был образован музыкально-драматический театр. В 60–70-е годы здесь зажглись звезды: Л. Травкина, Б. Киселев, С. Скорова, Л. Данилова и др.
В настоящее время театр, храня верность традициям музыкальной классики, находится в поиске новых форм. В его репертуаре появились такие жанры, как камерная опера, модерн-балет, мюзикл, музыкально-поэтическая композиция, музыкальная драма, оперы-буфф и др. Театр пробует различные сценические формы. Стали активно появляться спектакли малой формы.
Учреждение постоянно осваивает новые сценографические решения. Используются современные 3D-технологии, видеомэппинг. Театр не боится экспериментировать в выборе материала для своих постановок. За короткое время состоялись две мировые премьеры — водевиль К. Брейтбурга и Е. Муравьева «Так не бывает!» (2014 г.) и музыкальная комедия В. Баскина и О. Солода «Любовь без предрассудков» по пьесе В. Катаева (2015 г.), а также одна российская премьера — опера-буфф Ж. Оффенбаха «Синьор Фаготто» (2016 г.).