Северный морской музей находится в историческом центре города, именно отсюда Архангельск начинался как монастырский центр и как главный порт. Сам музей располагается в здании бывшего морского вокзала и между двумя пристанями: бывшей Соборной (ныне Красной) и так называемой пристанью Дальних экспедиций. Здесь же находился ресторан «Север» и таможенные склады.
Музей был создан в 1970-е годы моряками Северного морского пароходства.
В 1993 году музей получил статус государственного. Экспонаты музея «рассказывают» всю историю морского освоения Севера, начиная с морского устава, написанного Петром I (в нашем фонде перепечатка 1825 года).
Акцент сделан на основополагающую роль Архангельска — первого международного морского порта России, колыбели отечественного государственного и частного судостроения, центра изучения, освоения и практического использования ресурсов Арктики.
Экспозиционное пространство «Тысячелетия северного мореплавания» стилизовано под «парусный корабль», где декоративные конструкции выполнены в виде различных фрагментов судовых чертежей, деталей такелажа, элементов внутреннего и внешнего устройства судна.
Музейная экспозиция условно поделена на две тематические части: «Эпоха парусного флота» (XI — середина XIX века) и «Эпоха судов с металлическими корпусами» (конец XIX — XX века). Здесь наряду с подлинными историческими памятниками (архивными документам, редкими книжными изданиями, картами, поморскими снастями и т. д.) представлены разнообразные вспомогательные материалы — модели судов и кораблей, макеты судового оборудования, различные судовые устройства и приборы.